案例研究
以Intelligent Omics与Medicines Discovery Catapult和Arctoris Ltd合作的非小细胞肺癌新药发现为例:
Intelligent OMICS使用其专有的AI技术(I³技术平台)分析了自筹数据库中的9组肺癌数据集。这些数据集包括约2000名患者的人类转录组数据以及肺癌或健康诊断的确认。我们分析了KRAS野生型和突变病例的转录组数据,对潜在的系统生物学建模:首先创建了一个定义疾病(肺癌)和健康诊断的最重要的基因列表,然后基于数据中的证据在疾病通路图中对这些基因的相互作用建模,确定了四个基因是肺癌的驱动因素,但这些基因此前从未被发现。这代表了非小细胞肺癌潜在的新的生物靶点。
然后,我们引入Intellomx数字双胞胎,并评估这些相同的基因在心脏、大脑、肝脏和肾脏等脱靶器官的通路中的参与情况。结果由于下游毒性风险,我们取消了4个生物靶点中的3个,而没有进行任何湿实验室工作,将资源集中在剩余的靶点上。随后,我们与Medicines Discovery Catapult合作,为针对这一主要靶点的5种化合物提供了详细的评估。与此同时,对EGFR通路的分析,我们也找到了另外7个令人兴奋的肺癌新靶点。
下一步是在湿实验室中对AI技术确定的靶点进行验证,将验证过的靶点与可能的药物相匹配,此步由Medicines Discovery Catapult通过文献分析和化学信息学分析完成。然后,测试这些新药物对癌细胞的影响,此步由分包商Arctoris(拥有世界领先的全自动药物发现平台和机器人细胞系系统)在湿实验室中对前三种优先靶点用四种候选药物进行测试。
Arctoris的CEO Martin Bittner说道:“我们的系统验证了这些靶点,然后针对这些靶点进行了药物测试。结果很清楚:Intellomx确定的靶点确实很重要,是肺癌中以前未知的靶点,其团队确定的新药物调节了这些靶点,所有这些都与Intellomx AI预测的一致。”
Medicines Discovery Catapult的CEO Chris Molloy:“该项目完成了Intelligent OMICS开发的新药研发平台的概念验证。我们期待在未来看到这项技术的广泛应用,使整个行业受益。”
备注:
Medicines Discovery Catapult是一个链接英国生命科学社区的的国家机构(半官方),支持英国中小企业推动新药发现新方法的开发和工业化。
Arctoris有限公司位于牛津,建立了世界上第一个全自动化药物发现平台,为其全球合作伙伴和客户提供预先优化和充分验证的过程。